Comisia Uniunii Europene este corpul executiv al Uniunii Europene. Aceasta administrează acțiunea UE prin Directorate Generale împărțite pe domenii precum ministerele unui stat. Comisia este singura care poate propune inițiative de lege, în timp ce Parlamentul poate emite doar recomandări. Consiliul Uniunii are, la rândul său, putere legislativă de inițiere, dar momentan nu la nivelul critic al Comisiei.
Comisia publică rapoarte anuale pe mai multe direcții, una fiind sănătatea, rapoarte în care sănătatea mintală devine din ce în ce mai mult o prioritate. Pe lângă susținerea proiectelor europene din domeniul sănătății, Comisia are și un Grup de Coordonare pentru Promovarea Sănătății, Prevenirea Bolilor și Gestionarea Bolilor Netransmisibile (SGPP) înființat oficial în 2018. Grupul a fost format în completarea Obiectivelor de Dezvoltare Durabilă ONU care vizează și zona de sănătate, unde este atinsă și sănătatea mintală.
Grupul promovează bune practici, însă Uniunea are competențe reduse în zona de sănătate, limitându-se mai mult la recomandări și la indicarea direcțiilor generale, acțiunile Comisiei vor fi, deci, pe măsura acestor competențe. Recent, Comisia a anunțat că se va concentra pe întărirea Uniunii Europene a Sănătății, iar planul de acțiune EU4Health, propus de Comisie pentru perioada 2021- 2027, are o componentă de sănătate mintală.